Los hongos de la antigüedad probablemente vivían en el agua. Y es probable que hayan sido organismos unicelulares. Quizá vivían en material en descomposición o materia muerta. Obviamente, al menos en tamaño y estructura, un moho es muy diferente a una seta. Evidencia de ADN sugiere que casi todos los hongos tienen un único ancestro común. Los hongos más antiguos podrían haber evolucionado cerca de 600 millones de años atrás o incluso antes. Probablemente, eran organismos acuáticos con un flagelo. Los hongos colonizaron por primera vez la tierra al menos hace 460 millones de años atrás, casi al mismo tiempo que las plantas. Los fósiles de hongos terrestres se remontan a casi 400 millones de años atrás. Comenzando cerca de 250 millones de años atrás, los registros de fósiles fueron abundantes en muchos lugares. Podrían haber sido las formas de vida dominantes en la Tierra en ese momento.
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